Terzo capitolo dedicato alla flora ed alla vegetazione tipica delle zone umide. Il sito si compone di ben 13 habitat di interesse comunitario di cui cinque di alto valore biologico: le Lagune costiere, le Praterie di posidonia, le Steppe salate mediterranee, le Dune costiere con Ginepro e le Dune con foreste di Pino. Per quanto riguarda la flora sono presenti sei specie endemiche e, tra queste, la rara Linajola sardo-corsa. Da segnalare inoltre la presenza del Fungo di Malta, importante pianta parassita che vegeta in ambienti salmastri a spese di altre specie. Habitat e specie importanti quindi che godono di regimi di tutela rigidi, ma che l’opera dell’uomo mette comunque a rischio con comportamenti, il più delle volte in buona fede, dovuti all’ignoranza o alla leggerezza. Numerosi sono infatti nell’area i fenomeni di degrado dovuti al continuo espandersi delle specie aliene, al passaggio di fuoristrada sulle dune, all’eccessivo carico di bestiame, ma anche solo al passaggio di visitatori nelle aree più sensibili se in gruppi troppo numerosi.